Silaha mpya ya utambuzi wa ugonjwa wa kifua kikuu na ugunduzi wa upinzani wa dawa: kizazi kipya kinacholenga mpangilio (TNGs) pamoja na kujifunza kwa mashine kwa utambuzi wa ugonjwa wa kifua kikuu
Ripoti ya Fasihi: CCA: Mfano wa utambuzi kulingana na TNG na kujifunza kwa mashine, ambayo inafaa kwa watu walio na kifua kikuu cha bakteria na ugonjwa wa meningitis ya kifua kikuu.
Kichwa cha Thesis: Utaratibu wa kizazi kijacho unaolenga na kujifunza kwa mashine: Mkakati wa utambuzi nyeti wa hali ya juu wa tubulars za mapafu na meningitis ya tubular.
Mara kwa mara: 《Clinica Chimica Acta》
Ikiwa :: 6.5
Tarehe ya kuchapishwa: Januari 2024
Imechanganywa na Chuo Kikuu cha Chuo cha Sayansi cha Wachina na Hospitali ya Beijing Chest ya Chuo Kikuu cha Matibabu cha Matibabu, Macro & Micro-mtihani ilianzisha mfano wa utambuzi wa kifua kikuu kulingana na kizazi kipya cha teknolojia inayolenga (TNGS) na njia ya kujifunza mashine, ambayo ilitoa Ultra-High Usikivu wa ugunduzi wa kifua kikuu na bakteria chache na ugonjwa wa meningitis ya kifua kikuu, ilitoa njia mpya ya utambuzi wa hypersensitivity kwa utambuzi wa kliniki ya aina mbili za kifua kikuu, na ilisaidia utambuzi sahihi, kugunduliwa kwa upinzani wa dawa na matibabu ya kifua kikuu. Wakati huo huo, hugunduliwa kuwa cFDNA ya mgonjwa inaweza kutumika kama aina inayofaa ya sampuli ya sampuli ya kliniki katika utambuzi wa TBM.
Katika utafiti huu, sampuli 227 za plasma na sampuli za maji ya ubongo zilitumiwa kuanzisha vikundi viwili vya kliniki, ambamo sampuli za maabara za utambuzi zilitumiwa kuanzisha mfano wa kujifunza mashine ya utambuzi wa kifua kikuu, na sampuli za utambuzi wa kliniki zilitumiwa kuthibitisha kuanzishwa kwa. Mfano wa utambuzi. Sampuli zote zililenga kwanza na dimbwi la kukamata la kukamata lililokusudiwa kwa kifua kikuu cha Mycobacterium. Halafu, kwa kuzingatia data ya mpangilio wa TB-TNGS, mfano wa mti wa uamuzi hutumiwa kufanya uthibitisho wa msalaba mara 5 juu ya mafunzo na seti za uthibitisho wa foleni ya utambuzi wa maabara, na vizingiti vya utambuzi wa sampuli za plasma na sampuli za maji ya ubongo zinapatikana. Kizingiti kilichopatikana huletwa katika seti mbili za mtihani wa foleni ya utambuzi wa kliniki kwa kugundua, na utendaji wa utambuzi wa mwanafunzi unapimwa na Curve ya ROC. Mwishowe, mfano wa utambuzi wa kifua kikuu ulipatikana.
Mchoro 1 Mchoro wa muundo wa muundo wa utafiti
Matokeo: Kulingana na vizingiti maalum vya sampuli ya DNA ya CSF (AUC = 0.974) na sampuli ya plasma cfDNA (AUC = 0.908) iliyoamuliwa katika utafiti huu, kati ya sampuli 227, usikivu wa sampuli ya CSF ilikuwa 97.01%, hali hiyo ilikuwa 95.65%, na Usikivu na maalum ya sampuli ya plasma ilikuwa 82.61% na 86.36%. Katika uchanganuzi wa sampuli 44 za paired za plasma cfDNA na DNA ya maji ya ubongo kutoka kwa wagonjwa wa TBM, mkakati wa utambuzi wa utafiti huu una msimamo wa juu wa 90.91% (40/44) katika plasma cfDNA na maji ya ubongo, na unyeti ni 95.45% (42/44). Katika watoto walio na kifua kikuu cha mapafu, mkakati wa utambuzi wa utafiti huu ni nyeti zaidi kwa sampuli za plasma kuliko matokeo ya kugundua ya Xpert ya sampuli za juisi ya tumbo kutoka kwa wagonjwa sawa (28.57% dhidi ya 15.38%).
Mtini. 2 Uchambuzi wa utendaji wa mfano wa utambuzi wa kifua kikuu kwa sampuli za idadi ya watu
Mtini. 3 Matokeo ya utambuzi wa sampuli za paired
Hitimisho: Njia ya utambuzi wa hypersensitive ya ugonjwa wa kifua kikuu ilianzishwa katika utafiti huu, ambayo inaweza kutoa zana ya utambuzi na unyeti wa juu wa kugundua kwa wagonjwa wa kliniki walio na kifua kikuu cha oligobacillary (utamaduni hasi). Ugunduzi wa kifua kikuu cha hypersensitive kulingana na plasma cfDNA inaweza kuwa aina inayofaa ya utambuzi wa ugonjwa wa kifua kikuu na ugonjwa wa meningitis (sampuli za plasma ni rahisi kukusanya kuliko giligili ya ubongo kwa wagonjwa wanaoshukiwa ugonjwa wa kifua kikuu).
Kiunga cha asili: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0009898123004990? kupitia%3dihub
Utangulizi mfupi wa Bidhaa za Ugunduzi wa Kifua kikuu cha Kifua kikuu cha Micro & Micro
Kwa kuzingatia hali ngumu ya sampuli ya wagonjwa wa kifua kikuu na mahitaji anuwai, Macro & Micro-Mtihani hutoa seti kamili ya suluhisho za NGS kwa uchimbaji wa pombe kutoka kwa sampuli za sputum, ujenzi wa maktaba ya Qualcomm na mpangilio, na uchambuzi wa data. Bidhaa hizo hushughulikia utambuzi wa haraka wa wagonjwa wa kifua kikuu, kugundua dawa ya kifua kikuu, uchapaji wa kifua kikuu cha Mycobacterium na NTM, utambuzi wa hypersensitivity ya kifua kikuu cha bakteria na watu wa kifua kikuu, nk.
Vifaa vya kugundua serial kwa kifua kikuu na mycobacteria:
| Bidhaa hapana | Jina la bidhaa | Yaliyomo ya Upimaji wa Bidhaa | Aina ya mfano | Mfano unaotumika |
| HWTS-3012 | Wakala wa kutolewa kwa mfano | Kutumika katika matibabu ya pombe ya sampuli za sputum, imepata nambari ya rekodi ya darasa la kwanza, vifaa vya mashine ya Sutong 20230047. | sputum | |
| HWTS-NGS-P00021 | Kitengo cha kugundua idadi ya Qualcomm kwa kifua kikuu cha hypersensitive (njia ya kukamata) | Ugunduzi usio wa uvamizi (kioevu biopsy) hypersensitivity kwa kifua kikuu cha pulmona-hasi na vinundu vya ubongo; Sampuli za watu wanaoshukiwa kuambukizwa na ugonjwa wa kifua kikuu au ugonjwa usio wa kifua kikuu walichambuliwa na metagenomics ya hali ya juu, na habari ya kugundua ikiwa ugonjwa wa kifua kikuu au ugonjwa usio wa tuberculosis uliingizwa na habari kuu ya kupinga dawa ya kwanza ya mycobacterium tubercculosis iliambukizwa na habari kuu ya kwanza ya kupinga dawa ya mycobacterium tuberculosis iliambukizwa na habari kuu ya kwanza ya kupinga dawa ya mycobacterium tubercculosis iliambukizwa na habari kuu ya kwanza ya dawa ya mycobacteris walitolewa. | Damu ya pembeni, maji ya lavage ya alveolar, hydrothorax na ascites, sampuli ya kuchota, maji ya ubongo. | Kizazi cha pili |
| HWTS-NGS-T001 | Kuandika kwa Mycobacterium na Kitengo cha Upinzani wa Dawa (Njia ya Upangaji wa Multiplex) | Mtihani wa kuandika wa Mycobacterium, pamoja na MTBC na 187 NTM；Ugunduzi wa Upinzani wa Dawa ya Kifua kikuu cha Mycobacterium inashughulikia dawa 13 na maeneo 16 ya msingi ya mabadiliko ya aina ya dawa. | Sputum, alveolar lavage giligili, hydrothorax na ascites, sampuli ya kuchota, maji ya ubongo. | Jukwaa la pili/la tatu |
Vivutio: HWTS-NGS-T001 Mycobacterium Kuandika na Kitengo cha Ugunduzi wa Dawa (Njia ya Amplization ya Multiplex)
Utangulizi wa bidhaa
Bidhaa hiyo ni ya msingi wa dawa kuu za kwanza na za mstari wa pili zilizoelezewa katika miongozo ya matibabu ya TB, macrolides na aminoglycosides kawaida hutumika katika miongozo ya matibabu ya NTM, na tovuti za upinzani wa dawa hufunika kundi moja la tovuti zinazohusiana na dawa kwenye WHO Mycobacterium Kifua kikuu cha Kifua kikuu cha mabadiliko ya mabadiliko ya mabadiliko, na aina zingine za kupinga dawa na tovuti za mabadiliko kulingana na uchunguzi na takwimu za Maelezo ya juu ya bao nyumbani na nje ya nchi.
Utambulisho wa kuchapa ni msingi wa aina ya NTM iliyofupishwa katika miongozo ya NTM iliyochapishwa na Jarida la Kichina la Kifua kikuu na Magonjwa ya Kupumua na makubaliano ya wataalam. Primers iliyoundwa iliyoundwa inaweza kukuza, mlolongo na kufafanua zaidi ya spishi za NTM 190.
Kupitia teknolojia ya ukuzaji wa PCR inayolengwa, jeni za genotyping na aina sugu ya dawa ya mycobacterium ziliimarishwa na PCR nyingi, na mchanganyiko wa amplicon wa aina ya lengo uliyopatikana ulipatikana. Bidhaa zilizoimarishwa zinaweza kujengwa katika maktaba za kizazi cha pili au za kizazi cha tatu, na majukwaa yote ya kizazi cha pili na ya kizazi cha tatu yanaweza kuwekwa chini ya mpangilio wa hali ya juu ili kupata habari ya mlolongo wa aina ya lengo. Kwa kulinganisha na mabadiliko yanayojulikana yaliyomo kwenye hifadhidata ya kumbukumbu iliyojengwa (pamoja na orodha ya mabadiliko ya mabadiliko ya kifua kikuu cha WHO ya WHO ya WHO na uhusiano wake na upinzani wa dawa), mabadiliko yanayohusiana na upinzani wa dawa au uwezekano wa dawa za anti-kifua kikuu ziliamuliwa. Ikichanganywa na suluhisho la matibabu ya sampuli ya sputum iliyofunguliwa ya jumla na ndogo, shida ya ufanisi wa kiwango cha juu cha asidi ya seli inatumika moja kwa moja kwa sampuli za kliniki za sputum.
Anuwai ya kugundua bidhaa
34Jeni zinazohusiana na dawa ya18Dawa za kupambana na kifua kikuu na6Dawa za NTM ziligunduliwa, kufunika297tovuti za upinzani wa dawa; Aina kumi za kifua kikuu cha Mycobacterium na zaidi ya190Aina za NTM ziligunduliwa.
Jedwali 1: Habari ya dawa 18+6+190+NTM
Faida ya bidhaa
Kubadilika kwa nguvu ya kliniki: Sampuli za sputum zinaweza kugunduliwa moja kwa moja na wakala wa kujiona bila utamaduni.
Operesheni ya majaribio ni rahisi: duru ya kwanza ya operesheni ya ukuzaji ni rahisi, na ujenzi wa maktaba umekamilika kwa masaa 3, ambayo inaboresha ufanisi wa kazi.
Upinzani kamili na Upinzani wa Dawa: Kufunika tovuti za kuchapa na kupinga madawa ya MTB na NTM, ambazo ni vidokezo muhimu vya wasiwasi wa kliniki, uchapaji sahihi na ugunduzi wa upinzani wa dawa, kuunga mkono programu ya uchambuzi wa kujitegemea, na ripoti za uchambuzi kwa kubonyeza moja.
Utangamano: Utangamano wa bidhaa, kuzoea kwa majukwaa ya ILM na majukwaa ya MGI/ONT.
Uainishaji wa bidhaa
| Nambari ya bidhaa | Jina la bidhaa | Jukwaa la kugundua | Maelezo |
| HWTS-NGS-T001 | Uchapaji wa Mycobacterium na Kitengo cha Ugunduzi wa Dawa (Njia ya Amplization ya Multiplex) | Ont 、 Illumina 、 MGI 、 Salus Pro | 16/96rxn |
Wakati wa chapisho: Jan-23-2024